Cufon.replace('span');
Cufon.replace('li');
Cufon.replace('h1');
Cufon.replace('p');
questa parte (credo) gestisce la gerarchia forse aggiungendo (vado a casaccio non conosco minimamente lo script)
Cufon.replace('div'); tra h1 e p forse risolvi, se cosi non fosse, prova a contattare il realizzatore e gli spieghi il problema.