Il box che contiene il menù lo puoi definire position:fixed. In questo modo rimarrà sempre fermo come fosse un adesivo appiccicato sul vetro dello schermo!

Per fare lo scroll solo del contenuto del testo devi applicare a tale div, overflow:auto; in modo che compaia la barra di scorrimento all'occorrenza.

Direi però che se fai lo scrollo al div del contenuto... la pagina a quel punto non scrolla più (a meno di aver forzato l'altezza di tale div a valori superiori dell'altezza della finestra...) e quindi ti puoi risparmiare il position:fixed al menù....