Ho fatto ciò che mi hai detto, ma non ho potuto svuotare la cartella temp poichè a ogni tentativo mi dice "impossibile cancellare il file perché attualmente in uso"
Sì sono file che probabilmente stai usando.
L'importante è che non siano eseguibili. (.exe)
Ho provato a fare hijackthis ma dopo la scansione non mi aha trovato nulla
Questa non l'ho capita.
P.s. la deframmentazione la faccio con mydefrag o col tool windows?
Con quello a cui sei abituato farla.

la scandisk e la deframmentazione non le ho fatte
Prenditi il tempo che ti serve, sono importanti, per ottimizzare il pc.
Non sempre è possibile cavarsela in 10 minuti.

P.S:
Ho provato a fare hijackthis ma dopo la scansione non mi aha trovato nulla
Se ti riferisci alla scansione di hijackthis per la ricerca di ADS nocivi; bene.
Vuol dire che non hai quel tipo di infezione.