prova cosi:
codice:
<script>
var lon = [];
var lat = [];
var ele = document.getElementsByTagName('div');
var i = 0;
for(i; i<ele.length; i++){
if(ele[i].className=='latitudine'){
lat[i]=ele[i].innerHTML;
}
if(ele[i].className=='longitudine'){
lon[i]=ele[i].innerHTML;
}
}
</script>
ho usato due array, forse puoi farlo anche con un aray bidimensinale, ma conoscendole non mi sbilancio.