dipende... se i file in questione sono "inclusi" (cioè fai degli "include 'nomefile.php'") nell'esempio che ti ho fatto...

...in domino1 dalla sua cartella principale faresti semplicemente "include 'cartellacondivisa/nomefile.php'", mentre in dominio2 faresti "include '../dominio1/cartellacondivisa/nomefile.php'.

Potrebbero esserci problemi di "permessi", ma magari puoi risolverli, inoltre è probabile che la struttura di cartella sia più "complessa", ma si tratta solo di aggiungere dei "../" in più