Infatti... pienamente d'accordo!! Se poi hai già esperienza di MySQL, dovrebbe essere una passeggiata utilizzare SQLite (che personalmente preferisco), dato che devi effettuare meno passaggi... Io lo uso spesso e utilizzo come driver JDBC questi:

http://www.zentus.com/sqlitejdbc/

che sono pure-Java e quindi non devi includere altre librerie aggiuntive.
Per il resto, devi solo vedere come cambia la sintassi per la creazione delle tabelle e poco altro; le istruzioni select, update e delete sono invece identiche.