avrà sicuramete quell'effetto,
di norma nelle textarea si sceglie il tipo di contenuto, html o testuale, e in base a questa selezione poi si va a trattare il contenuto.
se non vuoi, o non puoi, aggiungere questa selezione potresti usare una funzione di detect con espressione regolare che si occuperà di trovare eventuali tag html, se presenti tratterai il contenuto come html altrimenti come testo (con la nl2br)