Basta escludere dal controllo i tag ammessi:
codice:
<script language="javascript">
function htmlno(){ 
   modulo=document.form1.testo;
   var escludi=modulo.value.replace(/<u>/g,'').replace(/<\/u>/g,'').replace(/[i]/g,'').replace(/<\/i>/g,'').replace(/[b]/g,'').replace(/<\/b>/g,'');
   if(escludi.indexOf("<")!=-1 || escludi.indexOf(">")!=-1 ){
      alert("I soli tag html ammessi sono <u>,[i],[b]");
      modulo.focus();
      return false;
   }
}
</script>