ciao hai usato i tag thead e tbody per definire la prima riga e i dati da ordinare nella tabella che crei?

io l'ho usato in questo modo e funziona
codice:
<script type="text/javascript">
$(document).ready(function() 
    { 	
	/*sortList: [[1,0], [1,0]] ordina per pratica
	sortList: [[4,0], [1,0]] ordina per ubicazione
	*/
        $("#tabella").tablesorter({sortList: [[2,0], [1,0]]} ); 
    } 
); 


</script>
il [a,b]
a serve a scegliere la colonna da ordinare
b l'ordinamento crescente o decrescente