Se ho ben capito tu vorresti ottenere qualcosa di simile alla funzione di youtube che ti permette di selezionare dei video e guardarli successivamente... solo che nel tuo caso si tratta di ricordarsi delle checkbox selezionate... ho capito bene? Se è cosi potresti usare javascript, il quale tramite ajax (per comodità) richiama una pagina php... e tramite questa pagina php dovresti memorizzare le scelte dell'utente 1) o in un cookie, 2) o in una sessione o 3) in un database... fatto questo devi modificare il tuo codice, in modo che prima di tutto legga il cookie, la sessione o il db, alla ricerca di eventuali checkbox precedentemente selezionati... e se ne trova qualcuno li confronta con quelli che stai attualmente visualizzando e se c'è un riscontro li seleziona.