Un file com non ha nessuna struttura*, è un singolo blocco di codice macchina che viene caricato in memoria ad una locazione fissata ed eseguito, puoi disassemblarlo con un qualunque disassemblatore x86.
* a meno che non sia un exe "camuffato"; lo distingui facilmente perché i .com possono essere al massimo di 64 KB, ovvero la dimensione di un segmento.