ti manca un cilco, tipo
$testo=fopen("prova.txt","r+"); //magari aprendo in scrittura con "r"
while(!feof($testo))
{
echo fgets($testo). "
";
//nel ciclo puoi fare le sostituzioni, magari aprendo il file anche in scrittura, se vuoi salvare le //sostituzioni effettuate
}
fclose($testo);