ciao per aprire una nuova finestra puoi usare il window.open

Codice PHP:
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y=window.screen.availHeight;

app window.open('paginadaaprire.htm''applicazione''width='+x+',height='+y+'toolbar=no,menubar=no,location=no,fullscreen=no, scrollbars=yes, resizable=yes,top=0,left=0,status=no');

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e per chiudere la finestra appena aperta con un link che deve essere all'interno di paginadaaprire.htm fai cosi:

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