Mi sono accorto che mette lo script prima di <!doctype html> e che me lo ripete poichè è in un ciclo php,ma i valori di idnumber e $stamp devono variare quindi come posso modificare?
Codice PHP:
<script language="javascript">
function countdownTime() { 
    now  = new Date(); 
    data =  new Date("April 3, 2012 21:11:10");  
    data.setYear("2012"); 
    idnumber = "5";
    diff = data - now; 

    ore = Math.floor( diff / (1000*60*60) ); 
    mn = Math.floor( diff / (1000*60) ); 
    sec = Math.floor( diff / 1000 ); 

    hh = ore; 
    mm = mn - ore * 60; 
    ss = sec - mn * 60; 
    countid = 'count' + idnumber;
        document.getElementById(countid).innerHTML=hh + ' ore ' + mm + ' min ' + ss + ' sec'; 
        if(diff < 0){ 
        document.getElementById(countid).innerHTML="Allenamento finito"; 
       } 
     } 
setInterval('countdownTime()', 1000 ); 
</script>