L'approccio corretto per gestire una relazione molti-a-molti, come nel casto articolo-tag, è usare una tabella ponte: crea una tabella in mysql che si chiama articolo_tag, con 2 campi, articolo_id e tag_id, chiave primaria su entrambi i campi e chiave esterna verso i rispettivi id.
A quel punto nella table tag non ti serve tenere il numero di occorrenze, basta fare dei semplici count su articolo_tag