allora credo di aver trovato il problema.
il file php lancia con successo l'applicazione, l'applicazione esegue la sua funzione, però con 2 problemi.
1) il batch lanciato da php esegue la sua funzione, ma lancia l'applicazione desiderata in modo invisibile, cioè l'applicazione funziona, stà girando, ma non è visibile nel task manager e nemmeno visibilmente.
2) il file php interrompe la sua esecuzione lanciando il file batch e rimane in costante caricamento all'infinito..
non riesco risolvere..