Ciao.
Ho ttrovato il comando:
>taskkill /IM <nome immagine>

Ho fatto la seguente prova ed ha funzionato, da prompt del DOS:
>calc.exe
(ha aperto la calcolatrice)
>taskkill /IM calc.exe
(l'ha chiusa)
Quindi se metti nel Batch il comando, penso che vada....