Ho semplicemente identato il codice; controlla le graffe: sono tutte errate...
codice:
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main(void)
{
	//Array di interi che conterrà le frequenze dei singoli caratteri nell'ordine 1..0 A..Z a..z
	int occorrenzaCarattere[62];

	//Array di interi che conterrà le frequenze del carattere successivo a quello appena letto
	int occorrenzaSuccessivo[62];

	//Array di interi che conterrà le frequenze delle sequenze per ciascun carattere
	int occorrenzaSequenze[62];

	//Variabile ausiliaria nella quale memorizzo il carattere appena letto
	char carattereCorrente;

	//Variabile ausiliaria nella quale memorizzo il carattere precedente a quello letto
	char caratterePrecedente;

	//Per il punto 3, è a 1 se stavo già contando quella che stà leggendo come una sequenza di lettere uguali, e quindi non devo ricontarla, 0 altrimenti
	int contaSequenza;

	int seqcont;
	//Apro il file in modalità lettura
	FILE *pf;

	//pf = fopen(("caratteri.txt","r")!=NULL);
	pf = fopen ("caratteri.txt","r");
	if ( pf == NULL)
	{
		printf("Impossibile aprire il file");
		exit(1);
	}

	//Leggo carattere per carattere dal file finchè il file non è finito
	while((carattereCorrente = getc(pf))!=EOF)
	{
		//Verifico se il carattere letto è una cifra
		if ((carattereCorrente >= 48)&&(carattereCorrente <= 57))
		{
			//Se è una cifra la conta
			occorrenzaCarattere[carattereCorrente - 48]++;
			//se è in sequenza conta la sequenza per quel carattere
			if (carattereCorrente == caratterePrecedente +1)
			{
				occorrenzaSuccessivo[caratterePrecedente - 48]++;
			}

			if ((carattereCorrente == caratterePrecedente) && (seqcont==0))
			{
				contaSequenza = 1;
				occorrenzaSequenze[carattereCorrente - 48]++;
			}
			else
			{
				contaSequenza = 0;
			}
		}
	}
}
//Verifico se il carattere letto è una lettera maiuscola
if ((carattereCorrente >= 65) && (carattereCorrente <= 90))
{
	//Se è una lettera maiuscola la conta
	occorrenzaCarattere[carattereCorrente - 55]++;
	//se è in sequenza conta la sequenza per quel carattere
	if (carattereCorrente = caratterePrecedente +1)
		occorrenzaSuccessivo[caratterePrecedente - 55]++;
	if ((carattereCorrente==caratterePrecedente)&&(seqcont==0))
	{
		contaSequenza = 1;
		occorrenzaSequenze[carattereCorrente - 55]++;
	}
	else
	{
		contaSequenza = 0;
	}

	//Verifico se il carattere letto è una lettera minuscola
	if ((carattereCorrente >= 97) && (carattereCorrente <= 122))
	{
		//Se è una lettera minuscola la conta
		occorrenzaCarattere[carattereCorrente - 61]++;
		//se è in sequenza conta la sequenza per quel carattere
		if (carattereCorrente = caratterePrecedente +1)
		occorrenzaSuccessivo[caratterePrecedente - 61]++;
		if ((carattereCorrente==caratterePrecedente)&&(seqcont==0))
		{
			contaSequenza = 1;
			occorrenzaSequenze[carattereCorrente - 61]++;
		}
		else
		{
			contaSequenza = 0;
		}
	}
}