Non devi richiamarla, devi semplicemente renderla 'dinamica' in base al valore che recuperi dalla sessione, se per esempio il valore di sessione è un booleano puoi fare cosi:

codice:
$( "#dialog-confirm" ).dialog({
 resizable: false,
 modal: true,
 autoOpen: <%=session.getAttribute("attributoSessione")%>,
 buttons: {
 "Ok": function() {
 $("div#menu_navigazione").css("display","block");
 $('#overlay').fadeOut('fast');
 $( this ).dialog( "close" );
 }
 }
 });