Ho risolto così:
codice:
<div onClick="$('#popup_boxXXX ').fadeIn('slow')">
Dove al posto delle XXX, tramite PHP, richiamo l'ID.
In pratica ho "integrato il Javascript" nell'HTML.
Ora mi resta da capire se è scritto in modo corretto.
A funzionare funziona, ma forse non è la giusta sintassi!