Per quanto riguarda il numero 1:

Controlla che nel tuo template, all'interno della pagina home.php sia presente questo codice <?php get_sidebar(); ?> che è quello che serve per inserire a wordpress la Sidebar.

Per quanto riguarda la numero 2:

Non ho mai utilizzato quel plug-in ( se è quello che credo sia ).

Comunque ho trovato sul forum di Worpdress una discussione che credo faccia al caso tuo: http://wordpress.org/support/topic/wp_pagenavi-function

In poche parole il tuo tema comprende questa funzione che ti richiama i post precedenti e ti inserisce una serie di link ad essi in fondo pagina.

Solo che wordpress non nasce nativamente con quel plug-in, detto questo puoi percorrere due strade:

1) Installi il plug-in e in fondo pagina avrai i tuoi link agli articoli.
2) Se non ti interessa devi rimuovere manualmente i pezzi di codice in ogni pagina dove il tuo template richiama quel plug-in.

Spero di averti aiutato, un saluto