quindi il problema è l'application pool...
di norma dovresti prima installare il .net framework 4 e poi da IIS nella sezione applications pools basta cliccare con il destro e scegliere "aggiungi pool di applicazioni". (mettine due sia classic mode che integrated mode)

un altra cosa importante è che forse quando hai installato iis da installa applicazioni windows non hai messo la spunta in IIS->SERVIZI WEB->FUNZIONALITA SVILUPPO APLICAZIONI->ASP.NET... Questo è un problema in cui sono incappato anch'io non molto tempo fa.