Come indicato da lucavizzi, specifica la proprietà top da css.

Ti propongo una soluzione più compatta per ciò che vorresti fare:
codice:
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=ISO-8859-1" />
    <title>Untitled Document</title>
  </head>
  <body>
    <p id="paragrafo" onclick="cambiaposizione()" style="cursor:se-resize; position:absolute; top:0; left:0">questo è il testo dell'elemento di id paragrafo</p>
    <script type="text/javascript">
      function cambiaposizione(){
        var es = document.getElementById("paragrafo").style;
        es.top = es.left = (es.top=="100px"?"0px":"100px");
      }
    </script>
  </body>
</html>