dipende da come è fatto il sito, se hai il classico file "config.inc.php" che viene incluso da tutte le pagine, basta che metti un redirect ad inizio file e sei a posto
Codice PHP:
header("Location: working.html");
die(); 
sennò non puoi spostare tutto su una sottocartella da bloccare con un htaccess, e lasciare nella root solo il file di coming soon?