codice:
<?php
$miavariabile = 5;
...
...
?>

<script>
$(document).ready(function(){
var miavariabilejs = '<?php echo $miavariabile; ?>' //se la variabile è un numero non ci vanno gli apici che servono solo per le stringhe
...
/* a piacere */
function modificavar(){
//riscrivo la variabile
miavariabilejs = 'ciao mondo';
}
})
</script>