Originariamente inviato da Patrick Jane
Teoricamente se scrivi con println() dovrebbe andare a capo. Puoi sempre inserire \r\n al termine della riga.
in realtà println scrive una nuova linea, che su sistemi windows corrisponde a \r\n, mentre su sistemi unix solo a \n.
Se il file è creato su unix, su windows blocco note non è detto che "capisca" che solo \n è il carattere di nuova linea.

Prova ad aprirli con notepad++ e vedi se ti perdi la linea