Non conosco particolarmente nessuno dei due build system, ma cercando su Google "ant vs maven" mi pare ci sia una valanga di materiale... stando così le cose, dovresti documentarti un attimo ed eventualmente porre domande un po' più specifiche sulla questione...

In ogni caso, dato che si tratta di build system usati soprattutto con Java, sposto nell'apposita sottosezione.