Farlo aprire in una pop-up vuol dire farlo aprire in un browser, il quale si va a cercare l' applicazione specifica - se c'è - installata sulla macchina per riprodurre il file.
Non so niente di quei cosi, ma prova questo (l' mp3 ha un suo peso, pazienta per il primo download):

codice:
<script type="text/javascript">

function audiovai(){
window.open("http://solargeneral.com/audio/marching-music/music-of-fascist-italy/stornelli-legionari.mp3", "audio", "top=0, left=0, width=200, height=100");
}

window.onload=audiovai;

</script>