se ho ben capito devi "scontornare" le parti di un immagine giusto?
con photoshop puoi usare lo strumento "lazo magnetico" ripercorrendo il contorno dell'immagine che ti interessa ed una volta generato il contorno salvare la selezione su un nuovo livello.
A quel punto butti tutto quello che non ti serve più e salvi come GIF con trasparenza, così ti scegli anche il colore esatto verso cui impostare tale trasparenza.

spero di esserti stato di aiuto
sto anch'io alle prime armi.

ciao