ma se ti recuperi il codice html della pagina tramite php? non mi sembra il caso di scomodare js per questioni del genere. Ti dovrebbe bastare usare il metodo file_get_contents di php, poi ti fai il parse del codice e con xpath e recuperi i valori che ti interessano. Se invece vuoi continuare con js, ti dovrebbe bastare questa modifica:
codice:$(document).ready(function(e) { $(".subsequence").each(function(index, element) { var element2=element + " .subsequence .header"; $(element2).css("background-color","#FF0"); alert($(element2).html()); }); });

Rispondi quotando