Ma avevi detto che il tuo problema ero solo come effettuare il confronto dato che avevi un'unica stringa con tutti i valori, invece qui il problema è che non riesci a fare neanche il confronto singolo. Hai problemi anche con un semplice if.

Codice PHP:
...
if ($rows[5]== "3" or "9"){  
... 
Magari così:

Codice PHP:
...
if ($rows[5] == "3" or $rows[5] == "9"){  
...