La risposta è semplice: non si fa.
E' il singolo utente mysql (il client più precisamente) ad avere una "visibilità", ma comunque non ha il minimo senso, perchè non riesci ad interrompere a metà un lungo thread mysql.

Se non buttanto giù del tutto il server (es. kill -9).

Direi di cambiare strategia per l'applicazione.