Impostando come "fixed" la sezione A ottengo che appena visualizzo la pagina, la sezione A e B sono sovrapposte, scrollando la pagina si muove solo la B.

Il problema però è che le 2 sezioni sono sovrapposte fin da subito, la sezione B non è nella posizione che si vede nell'immagine del primo post.
Impostando un margin-top per la sezione B, anche la A si sposta in basso, restandosovrapposta alla B.

Per adesso i div sono dichiarati così
<div id='sezioneA' style='position:fixed;z-index:999'>

<div id='sezioneB' style='border:solid black 1px;width:600px;height:800px;'>