L'inclusione dei file in php è preistoria. No, veramente: non lo fare. Non si fa più. Se trovi qualcuno che ti parla di inclusione di file in php, fuggi via. Se trovi una guida su php che ti parla di include, è obsoleta.
Oggi si fa così: metti ogni classe in un file separato e usi spl_autoload_register() http://php.net/manual/it/function.sp...d-register.php
Al limite puoi avere qualche require_once nel tuo front controller.