Puoi usare direttamente Excel, ovvero da codice:
- aprire il foglio
- leggere dalle celle i valori
- creare un nuovo foglio (o aprirne uno tuo)
- copiarvi i valori estratti dal primo.

per fare questo si usa l'Automazione di Excel:

VS2010 - Early-Late Binding in VB.NET con Excel
http://nuke.vbcorner.net/Progetti/NE...T/Default.aspx