MdE2005 grazie per il tuo intervento.
La soluzione che hai postato sarebbe la piu semplice e intuitva,se non che trasforma ogni singola lettera in un byte,producendo cosi 12 byte,quando io ho bisogno di 6 byte contenente ogniuno 2 caratteri.
Mi scuso per l'essermi espresso male riguardo all'md5,ma sono a conoscenza del fatto non è un formato stringa ma un tipo di algoritmo di crittanalisi.

valia grazie anche a te della risposta.
Non ho esattamente capito cosa intendi per "base 64".La stringa è una normalissima String.