Javascript "gira" lato-client, per passargli delle variabili lato-server basta incorporarle nel sorgente della pagina stampandole a video.
codice:
<script type="text/javascript>
function tuaFunzione(){
   var lat=<% out.print(latitudine); %>;
   var lan=<% out.print(longitudine); %>;
   alert(lat+':'+lan);
}
</script>
Ciao