Devi aggiungere la libreria <stdlib.h> e aggiungere alla fine del programma (prima della chiusura del main, naturalmente) una linea di codice:

system("PAUSE");

che ti permette di vedere il risultato dell'esecuzione del programma e attende che tu prema un tasto qualsiasi per chiudere il programma.
Altrimenti esegui l'exe da linea di comando, e non avrai problemi di questo genere.

Comunque come IDE ti consiglio CodeBlocks o WxDev-C++.