Non proprio... il pulsante di submit diventa simile a questo:
codice:
<input type="button" value="Upload" onclick="closeSelf();"/>
prima della chiusura del tag <head> inserisci questo:
codice:
<script type="text/javascript">
function closeSelf(){
document.forms['nomeform'].submit();
       window.close();

}
</script>
devi verificare una cosa:
nel tag form deve essere presente l'attributo "name" valorizzato, e nel codice javascript devi sostituire "nomeform" con il valore dell'attributo "name" del tag form