Dubito che tu possa trovare alcunché di simile, sono linguaggi con caratteristiche/costrutti molto diversi (in VB.NET non esistono i puntatori, tanto per cominciare). Se vuoi sfruttare quel codice, la cosa più sensata è trasformarlo in una dll e chiamarlo dal programma VB.NET tramite P/Invoke.
In alternativa, puoi sempre provare ad implementare la FFT in VB.NET.