Salve a tutti, sarò breve...(phpmailer per php5/6)

codice:
$mail->Send(); // send message
?><script>alert('Registrazione confermata');</script>
La faccenda è semplice, non va il JS a me no che non commenti il Send(). In pratica, dopo il send è come se ci fosse un exit (ma nella classe non è cosi).

Come lo risolvo secondo voi?