ciao,
credo che potresti provare ad usare la exec() o shell_exec(), se non è stata disabilitatà
Codice PHP:
//Diamo per scontato che siamo in ambiente windows;
//possiamo usare il comando tasklist per una lista dei processi attivi
$output = shell_exec("tasklist");
if(false === strpos( $output, "mioeseguibile.exe") ){
echo "mioeseguibile.exe non è in esecuzione!";
}else{
echo "mioeseguibile.exe è in esecuzione!";
}