la stessa che per app native.
ad esempio per ios, crei un progetto in xcode aggiungendo il framework phonegap.
lo compili e poi segui la procedura che la apple descrive nella documentazione ufficiale.
o cmq ci sono vari siti/blog che ne parlano.
ma cmq devi essere sviluppatore apple e usare xcode.

per android non saprei di preciso, ma più o meno è uguale.