explode genera un array, quindi nn ha senso fare echo

$str = "{%=file.name%}";
echo $str ."A ";
$name = explode(".", $str);
print_r ($name);
$parts = explode("_", $name[0]);
print_r( $parts);
echo count($parts)."D ";

Detto ciò, visto che non so cosa è quella roba tra le {%%}, se a $str assegni 1_1.jpg funziona lo stesso