Il formato di phpmyadmin non è completamente compatibile con mysqldump, qui si vede bene.
Innanzitutto le opzioni aggiuntive di mysqldump servono solo se il db è in uso al momento del backup, altrimenti sono inutili.
Inoltre puoi usare --opt, che fa essenzialmente tutto da solo.

Per ripristinare hai due possibilità:
1- usi mysql (a riga di comando) invece di phpmyadmin
2- fai il dump con phpmyadmin (invece che mysqldump) e fai il restore sempre con phpmyadmin

c'è anche la terza, ovvero correggere a mano (notepad++) il dump, se è piccolo