Sono riuscito a risolvere (in parte) il problema! Ma non capisco come mai non riesco ad aggiornare in maniera corretta il valore massimo per ogni giorno e colonna...
qualcuno mi dice dove sbaglio?

codice:
public void trovaMax(){
	
		double max = Double.MIN_VALUE;
	
		double[][] valore = new double[365][100];
               
                for(int k = 0;k<365;k++) {
                                  for(int j=0; j<100; j++){
                                          for(int i= 0; i<100;i++) {
                                          //valore[k][j]=misure[i][j][k];
                                         
                                          }
                                          for(int i= 0; i<100;i++) {
                                     if( misure[i][j][k] > max )  
                                                   max = misure[i][j][k];
                                                   
                                                   
  
   
                    
                                     }
                                   System.out.println("Il giorno  " + k + "e la colonna " + j + " ha il valore massimo pari a " + max );  
                           
                           }    
                                 
                  
                                             
                }

                                                    
    }