Dipende da cosa intendi per "tracciare".
Se vuoi solo sapere se ha pagato o no basta che prevedi nel db una tabella pagamenti con id dell'utente, data ed un campo 0/1 che ti di ce se il pagamento è stato effettuato o no.
Per decidere cosa scrivere in quel campo basta che ti rifai a ciò che ti risponde Paypal, se ti da esito positivo ci metti 1, se ti da esito negativo ci metti 0.