così, al volo:
- esegui una select sul db unendo la tabella di correlazione pizza/ingredienti con quella ingredienti e pizze;
- prendendo solo una pizza, il risultato conterrà un record per ogni ingrediente che sta su quella pizza;
- per ogni record, gestisci la lista degli ingredienti.

Quello che proponi tu, gestire pizza/ingredienti con un record per pizza e una serie di id separati da virgola, è quanto di meno efficiente puoi realizzare: immagina solo il bordello per modificare un ingrediente...