I meta tag che hai inserito manualmente sono inutili, a parte il description. Avendoli inseriti manualmente immagino che escano fuori uguali in tutte le pagine, cosa che è controproducente. Il plugin che hai installato, che è molto buono, inserisce anche esso dei meta tag nell'head del documento che potrebbero sommarsi ai tuoi e crear e duplicati. Ti consiglio di studiare come funziona il plugin e fare tutto via back end invece di toccare il tema di Wordpress.