La cosa più semplice probabilmente è usare un motore di JavaScript; vedi ad esempio qui per un wrapper Python di v8.

Se però lo script in questione è statico (non ci sono "pezzi" che variano di volta in volta) e tutto quello che devi fare è calcolare l'md5 della password ed incollarlo come nella funzione encode, puoi reimplementare giusto encode() in Python in due righe (sfruttando la funzione md5 già disponibile nella libreria standard Python).